國研院自研深海高流量環境去氧核醣核酸採樣模組 領先全台辨識西南沿海365種生物

國科會旗下國家實驗研究院台灣海洋科技研究中心2023年起自力開發深海高流量環境去氧核醣核酸(eDNA)採樣模組,自動採集深海生物殘留海中去氧核醣核酸(DNA)碎片,透過基因定序分辨棲息或活動生物,領先全台應用台灣西南沿海,辨識魚類、軟體類、甲殼類、深海珊瑚、棘皮類等365種深海生物,未來擴大應用調查台灣四周深海生態與長期監測生態。
傳統環境去氧核醣核酸採水過濾方式,研究人員取得約1至2公升水體過濾,透過聚合酶連鎖反應(PCR)1放大特定基因訊號,再結合次世代基因定序技術(NGS),定序完成基因比對資料庫,產出物種名單,但因受限單一物種,無法了解整體生態樣貌,加上放大基因訊號過程可能因物種基因片段差異影響結果。
深海高流量環境去氧核醣核酸採樣模組整合可耐受高壓環境深海馬達、可精準定量且具低樣本污染風險蠕動幫浦及可依研究需求更換孔徑過濾模組,每小時過濾逾100公升深海水,大幅提高採集效率。研究團隊導入第三代基因定序技術2,定序足量深海環境去氧核醣核酸,減量聚合酶連鎖反應擴增可能偏差,提升資訊準確性,還適用解析其他生物,加深多樣性調查廣度。圖/國研院提供、文/高培德

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